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LING ld
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CASdesign简介
“Design-Build-Test—Learn”是合成生物学研究的经典思路。随着CRISPR等基因编辑技术的普及和设计的规范化,繁琐、耗时且易出错的传统手工基因编辑已不适应合成生物学对于高通量研究的需求。为了帮助科研工作者从繁杂的DNA双链中解放双手,我们开发了CASdesign —— 基于CRISPR/Cas9和CRISPR/Cpf1基因编辑原理的在线工具。通过计算机辅助设计软件(BioCAD),实现对大肠杆菌、酿酒酵母等模式生物和其他非模式生物的基因进行批量、可视化、实时交互的编辑设计,并最终输出引物、导向性RNA(guide RNA,gRNA)等结果以指导下游实验。
CASdesign工具从最初第一版本,仅支持酿酒酵母基因组基于CAS9的编辑设计,到现版本的:
✨ 1)支持一切模式或非模式物种的基因编辑需求(点击新增基因组查看更多信息);
✨ 2)支持搜索位点名或自定义基因组区间的方法,实现多靶点的编辑设计(点击选择靶位点查看更多信息);
✨ 3)支持基于CRISPR/Cas9及CRISPR/Cpf1的基因编辑设计(点击参数设置查看更多信息);
✨ 4)添加指定基因组中特征片段,定义这些功能位点后可及时在位点选择处进行检索。(点击特征位点添加查看更多信息)。