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新增基因组文件
By
LING ld
登录CASdesign网站后,如果发现菌株列表
中没有您感兴趣的物种,您可以在左侧菜单栏点击进入新增物种
页面。点击上传物种文件
,根据弹出框的提示,填写新增物种基因组文件的基本信息,主要包括:
物种分类:从物种分类列表中选择一个合适的,如
Bacteria
;物种名:物种详细名称,可以有空格,如
copy_Saccharomyces cerevisiae S288CC
;别名或简称:物种名的别名或简称,不可以有空格,如果有多个单词,请以下划线
_
分割,如sacCer3
;物种编号:物种编号,非必填项,用于区分比如菌株的不同株系,如
S288C
。同上,不允许空格,多个单词需以下划线_
分割。
填写好物种基本信息后,上传物种对应的基因组GenBank
文件(支持gb
、gbk
、gbff
格式)。点击确认
,等待后台程序解析基因组文件。
解析任务会将GenBank中注释的所有基因位点信息提取出来,以便用户通过搜索基因名来靶向编辑区域。此外,还将分析GenBank中各染色体的信息,以便用户通过自定义染色体编号及起始终止位点靶向选择编辑区域。
注意
✨ 1)别名/简称_物种编号
(如sacCer3_S288C
)两个字段的组合将作为程序唯一识别一个基因组文件的信息,当程序检测到您设置的名字与系统内已有的基因组别名/简称_物种编号
重复时,会提示您。