#
新增基因组文件
By
LING ld
登录CASdesign网站后,如果发现菌株列表中没有您感兴趣的物种,您可以在左侧菜单栏点击进入新增物种页面。点击上传物种文件,根据弹出框的提示,填写新增物种基因组文件的基本信息,主要包括:
物种分类:从物种分类列表中选择一个合适的,如
Bacteria;物种名:物种详细名称,可以有空格,如
copy_Saccharomyces cerevisiae S288CC;别名或简称:物种名的别名或简称,不可以有空格,如果有多个单词,请以下划线
_分割,如sacCer3;物种编号:物种编号,非必填项,用于区分比如菌株的不同株系,如
S288C。同上,不允许空格,多个单词需以下划线_分割。
填写好物种基本信息后,上传物种对应的基因组GenBank文件(支持gb、gbk、gbff格式)。点击确认,等待后台程序解析基因组文件。
解析任务会将GenBank中注释的所有基因位点信息提取出来,以便用户通过搜索基因名来靶向编辑区域。此外,还将分析GenBank中各染色体的信息,以便用户通过自定义染色体编号及起始终止位点靶向选择编辑区域。
注意
✨ 1)别名/简称_物种编号(如sacCer3_S288C)两个字段的组合将作为程序唯一识别一个基因组文件的信息,当程序检测到您设置的名字与系统内已有的基因组别名/简称_物种编号重复时,会提示您。