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选择目标编辑区域
By
LING ld
登录进入CASdesign网站,在左侧菜单栏点击进入物种列表
,点击感兴趣基因组信息后的编辑基因
,将弹出选择位置
的窗口,软件将提供两种选择目标编辑区的方式:
⚡ 通过搜索位点名称,包括基因名、Locus标签名、表征位点名等检索编辑区域(Target named sites);
⚡ 通过指定染色体编号、起始终止位点自定义编辑区域(Target genomic regions)。
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1. Targrt named sites
在
位置
检索框内,输入该基因组中的基因名
、locus
编号或表征位点名
;允许选择多个位点。
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2. Target genomic regions
选择
染色体编号
、输入起始位点
和终止位点
以确定编辑区域;可以设置目标区域序列的方向,当设置为
负
时,在可视化编辑界面将展示负义链(Bottom Strand)5'-> 3' 的序列;允许设置多个基因区间。
提示
✨ 1)上述两种目标区选择方式允许混合使用,所有位点将一并在可视化编辑界面进行展示;
✨ 2)自定义基因组区域时,终止位点的坐标应大于等于起始位点的坐标;
✨ 3)自定义基因组区域时,边界坐标不能超出染色体区域范围。